肠旋转手术可能存在后遗症，但多数患者术后恢复良好。肠旋转不良手术主要用于矫正肠道解剖异常，术后可能出现肠粘连、慢性腹痛或消化功能紊乱等情况，但发生率较低。
肠旋转手术后较常见的后遗症是肠粘连，由于手术操作对腹膜造成刺激，可能导致肠道与其他组织异常黏连。患者可能表现为间歇性腹痛、腹胀或排便习惯改变。轻度粘连可通过适度活动、腹部按摩缓解，严重粘连需遵医嘱使用胰酶肠溶胶囊、双歧杆菌三联活菌散等药物调节肠道功能，必要时需二次手术松解。
少数患者术后可能出现慢性腹痛，与肠道神经敏感性改变或局部瘢痕形成有关。疼痛多集中在脐周或右下腹，进食后可能加重。建议采用少食多餐方式，避免辛辣刺激食物，可遵医嘱使用枯草杆菌二联活菌颗粒调节菌群，配合蒙脱石散保护肠黏膜。若疼痛持续超过1个月或伴随呕吐、便血，需及时复查排除肠梗阻。
术后3-6个月内应保持饮食清淡，优先选择易消化的粥类、蒸蛋等食物，逐步增加膳食纤维摄入。避免剧烈运动但需保证每日步行活动，促进肠蠕动。家长需定期监测患儿生长发育指标，记录排便次数及性状变化。术后1年需复查腹部超声或造影，评估肠道排列及蠕动功能恢复情况。
