植发手术的常见副作用包括轻微渗血、头皮肿胀和感染风险，严重并发症较为罕见。植发属于微创手术，主要由毛囊移植过程中头皮创伤引起暂时性反应，多数症状可在术后短期内自行缓解。
术后24小时内供区与受区可能出现针尖状渗血，用无菌纱布按压通常可止血。约三分之一人群在术后三天出现前额或眼周水肿，与麻醉液扩散有关，头部抬高睡姿可减轻症状。移植区毛囊炎发生率不足百分之五，表现为红肿脓疱，需使用抗生素软膏控制。部分人术后两个月出现暂时性脱发，源于毛囊进入休止期，属于正常生理过程。受区皮肤可能遗留轻度麻木感，因末梢神经受损，多数半年内逐渐恢复。
毛囊存活率低下通常与技术操作不当相关，表现为移植头发不成活。瘢痕体质者在传统FUT术后可能遗留线性瘢痕，选择FUE技术可规避。极少数出现供区毛发稀疏，与取材过度密集有关。术中血管损伤可能引发广泛出血，需紧急处理。永久性头皮感觉异常发生率低于千分之一，多与神经损伤深度相关。受区皮肤坏死属于灾难性并发症，与电凝过度或感染有关，需清创修复。
术后一周内避免剧烈运动防止创口裂开，使用医用洗发水轻柔清洁头皮。三个月内忌烟酒及辛辣食物，保持规律作息有助于毛囊重建。选择正规医疗机构可显著降低严重并发症概率，术前需完善凝血功能与传染病筛查。若发现移植区持续红肿渗液或发热，应及时返院处理。术后一年可通过毛囊检测评估最终成活率，必要时考虑二次加密移植。
