目前还没有一个明确的病因，就是有几个学说，常用的就是一个子宫内膜的一个内陷和子宫内膜的损伤机制，大多数和这个生育年龄以后，做人流、生育，然后子宫内膜有损伤的这样一个过程，因为子宫内膜没有黏膜下层，所以很容易子宫内膜腺体内陷，进入子宫肌层，那么后随着月经周期的改变，它也要增生，分泌，然后就产生一系列的症状。

还有另外的学说，比如说，分化，就是有些病人，尤其是那个年轻的女孩儿，也没有结婚，未婚的女孩儿，这种人子宫腺肌症，那么她们是怎么来的，这个就和人流、损伤，没有关系，那么考虑还是说他的子宫肌层的进行一个化生。

另外还有一个就是炎症因子的刺激，就是炎症因子学说，这个也可以导致子宫腺肌症。

另外子宫腺肌症也和遗传和这个免疫，还有一些个血管生成等等因素有关系，总之它是没有一个明确的病因，只是说有这样几个学说。