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皮肤型的HPV人群感染率非常普遍，如上述常见的寻常疣、趾疣、扁平疣等，无法得到具体的感染率，比较引起注意到是高危型的HPV感染和外生殖部位的低危型HPV感染引起的生殖部位疣和宫颈癌，据统计在全球的性病中，HPV感染引起的生殖部位疣占15-20%。

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关于女性生殖道感染HPV的流行情况，据2003-2004年来自的国家健康和营养研究课题的一个调查结果显示，14-59岁的HPV总感染率为26.8%,所以HPV感染在女性引起的负担超出之前的可能。的HPV感染的流行病学筛查未见大样本的报告，但是由HPV感染引起的性病中的尖锐湿疣的发病率在迅速上升，可能发病率应该是性病中很多的，因为存在很多的漏报和不报。每年约有13.15万新发现的宫颈癌,报告中发病率和出现生命危险率有增加趋势，且宫颈癌发病年龄年轻化，能够预见HPV感染引起在引起的损失的巨大。

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