HPV16阳性换另一家医院阴性可能是因为检测有误、检测试剂有差异、病毒载量较少等原因引起的，可以通过再次测试以及药物治疗的方式进行处理。

1、检测有误：HPV16是人乳头瘤病毒16型英文简称，HPV16是一种高危型病毒，阳性一般代表可能感染了该病毒。HPV16阳性换另一家医院阴性可能是因为检测有误导致的。需要进行多次检测才可以明确诊断。

2、检测试剂有差异：如果两家医院的检测试剂不是同一厂家生产，检测结果也会出现一定的差异，但是一般差异不大，可以再次检测明确诊断。

3、病毒载量较少：如果患者体内已经感染了HPV16，只是体内的病毒载量比较少，在检测时也会出现检测不出的情况，导致假阴性，使两家医院的检测结果出现不同。如果多次检测后为阳性，可以在医生的指导下使用重组人干扰素α-2b凝胶、保妇康栓、抗HPV生物蛋白敷料等药物进行治疗。

除了以上常见原因，还可能是因为试剂过期导致，如果多次检测为阳性，应积极配合医生进行治疗。日常生活中应避免辛辣饮食，以免加重疾病症状。