9岁孩子上课注意力不集中、搞小动作，这种情况较为常见，但不能简单地判定它绝对正常或不正常，需要综合多方面因素来分析。以下是一些常见的原因：

正常情况

生理发展特点：9岁孩子的大脑仍在发育中，他们的注意力集中时间有限，一般在20-30分钟左右。因此，在一堂课40分钟的时间里，孩子出现注意力不集中、搞小动作的情况是比较符合这个年龄段的生理发展规律的。

好奇心旺盛：这个年龄段的孩子对周围充满好奇，课堂上的一些小事物，如窗外的鸟叫声、文具等，都可能分散他们的注意力，导致他们搞小动作。

可能存在问题的情况

睡眠不足：如果孩子晚上睡眠不足，大脑和身体得不到充分的休息，第二天上课就容易出现注意力不集中、精神萎靡的情况，还可能通过搞小动作来缓解疲劳。

饮食不均衡：孩子如果挑食、偏食，导致营养摄入不足，特别是缺乏铁、锌等微量元素，可能会影响大脑的正常发育和功能，进而影响注意力。

学习环境干扰：如果教室环境嘈杂、座位周围有过多的干扰因素，或者与同学关系不融洽，都可能让孩子在课堂上分心，通过搞小动作来排解烦躁情绪。

心理压力过大：如家庭氛围不和谐、父母期望过高等，都可能使孩子产生心理压力，这种压力可能会在课堂上通过注意力不集中、搞小动作等行为表现出来。

心理或生理疾病：某些心理或生理疾病也可能导致孩子出现这样的问题，如注意缺陷多动障碍（ADHD）、学习障碍、焦虑症等，或是患有耳部感染、视力或听力问题等，会使孩子难以专注于课堂。

如果家长发现孩子长期存在上课注意力不集中、搞小动作的问题，并且已经对学习成绩和日常生活产生了明显的负面影响，建议及时寻求专业帮助，如咨询心理医生、儿童专家或教育专家等，以便准确判断原因并采取相应的措施。