肛瘘的形成主要与肛门周围的感染和炎症有关。在肛门附近，有一些小腺体负责分泌润滑物质。当这些腺体感染或堵塞时，脓液可能在肛门周围形成集合，不及时治疗逐渐形成一条通道。这个通道允许脓液从感染的内部区域排出，以减轻压力和炎症。

常见的引起肛瘘形成的原因包括：

肛门周围感染：肛门周围腺体感染、肛门炎等。

肛门周围炎症：肛门周围腺体炎症或直肠炎症。

肛门周围脓肿：脓液积聚导致异常通道形成。

肛门手术后感染：手术切口感染可能导致肛瘘。