Graves甲亢经131I治疗后，有可能发生甲状腺功能减退症（甲减），其机制尚不清楚。可分为早发甲减与晚发甲减。早发甲减指131I治疗后1年内出现，可能主要与患者甲状腺对射线较敏感、131I治疗剂量等因素有关，部分早发甲减患者可自行恢复。目前没有预测早发甲减的方法。降低131I治疗剂量可降低早发甲减的发生率，但一次率也降低。

晚发甲减指131I治疗1年后发生的甲减，统计显示晚发甲减呈逐年递增（每年以2％~3％的比例增加），可能主要与患者自身免疫功能异常有关，与131I剂量无关。

对于甲减，临床上容易诊断，也容易治疗，只有长期未治且甲减逐渐加重者才会出现严重的甲减症状和并发症。处理甲减的关键在于早期发现，及时用甲状腺激素进行替代治疗，不会对身体带来伤害。相反，甲亢得到及时纠正，还可减少因甲亢导致的并发症，如甲亢心脏病、甲亢危象等。