感染HPV病毒后，尿液中是否含有HPV病毒是一个复杂的问题，需要从多个方面进行分析。

首先，HPV病毒主要是一种嗜黏膜和皮肤上皮组织的病毒，它主要感染人体皮肤和黏膜的复层鳞状上皮，如子宫颈、外阴、阴道等生殖道部位，以及口腔、咽喉等黏膜部位。这些部位是HPV病毒的主要栖息地，而尿液则是由肾脏过滤血液后产生的液体废物，主要成分是水、无机盐、尿素等，并不直接包含HPV病毒颗粒。

然而，在某些特殊情况下，如患者存在泌尿系统感染或HPV感染导致生殖部位、肛门等部位的病变，且这些病变部位与尿道相邻或有所接触，那么尿液在流经这些区域时，可能会暂时性地携带少量HPV病毒。但这种情况下的病毒含量通常很低，且病毒在尿液中的存活时间和传染性都相对较弱。

此外，值得注意的是，尿液中的HPV病毒检测并非HPV感染诊断的常规方法。临床上，HPV感染的诊断通常依赖于对感染部位（如宫颈、外阴等）的直接取样和检测。尿液中的HPV检测更多用于科研或特殊情况下的辅助诊断，且其检测结果需要谨慎解读。

综上所述，感染HPV病毒后，尿液中一般不含有HPV病毒，但在特殊情况下可能暂时性地携带少量病毒。为了准确判断HPV感染情况，建议进行专门的HPVDNA检测等医学检查，并遵循医生的建议进行诊断和治疗。同时，保持个人卫生习惯、避免与HPV感染者密切接触、接种HPV疫苗等措施也是预防HPV感染的有效方法。