40％的血管瘤可发生并发症，并发症因血管瘤位置、大小、生长速度不同而异。并发症可以是功能性的，也可以是器质性的，常见溃疡、出血、感染、心力衰竭、视力受损、气道阻塞、喂养困难、外耳道阻塞等。

溃疡是血管瘤常见的并发症，其次是出血。溃疡常发生在生长期，于易摩擦部位更易出现。溃疡疼痛，可以继发感染和出血，后多瘢痕愈合。出血多是由于局部压力增加而导致静脉渗血，但需要排除系统性的凝血障碍或者动静脉畸形。感染也是婴儿血管瘤常见并发症之一，感染一方面是原发性的，但更多的是继发于溃疡，于难护理部位如口腔和肛周更易发生。

混合型血管瘤可以导致大血管的分流，由此引起高输出量性心力衰竭。眼周的血管瘤可以导致散光、眼睑下垂、斜视、屈光不正、眼球前突、弱视和失明。颈部或面部下方的血管瘤可能伴发声门下血管瘤，引起气道阻塞，严重时可以导致死亡。口腔或鼻腔内血管瘤可以引起喂养困难。耳部血管瘤可以导致外耳道阻塞，短期内可能影响听力，但是长期对听力的影响不大。面部巨大型婴儿血管瘤过度生长可以侵袭面部骨骼或者耳软骨。