运动后腿疼的原因有：第一、血管因素，当下肢动脉轻度缺血时，会造成间歇性跛行，诱发疼痛；第二、肌肉问题，正常情况下肌肉处于舒缓状态没有问题，但运动后肌肉紧张收缩，就会产生疼痛，如腓肠肌炎在活动的时候也会出现疼痛问题。