上个世纪六七十年代肠外瘘的病死率能达到百分之六七十，现在有了感染源的控制技术，营养支持这项技术的介入，目前的病死率平均已经不到百分之二十，在南京军区总医院这个病死率会更低。但在一些处理肠外瘘还不规范的单位，病死率还会再高一些。
