面、头、颈、肩发作性剧痛可能是由于蝶腭神经节神经痛所引起的。蝶腭神经节神经痛是由于蝶窦感染引起翼管神经刺激或炎症，导致蝶腭神经节受到刺激或炎症而引起的疼痛。这种疾病多见于成人，特别是女性，表现为鼻、面、眼、耳、头、颈以及肩部的发作性剧痛，多为单侧性发病，疼痛性质多为发作性或持续性剧痛，可为烧灼样、刀割样或针刺样等性质，通常疼痛较为剧烈，难以忍受，可伴鼻塞、流涕、流泪等交感神经受累的症状。
面、头、颈、肩发作性剧痛还可能与颈椎病、颈肌纤维肌炎等疾病有关。颈椎病可能导致颈部肌肉紧张和疼痛，颈肌纤维肌炎则可能引起颈部和肩部肌肉的疼痛和不适。局部受凉、姿势不当等也可能导致肌肉疲劳和不适，从而引起面、头、颈、肩发作性剧痛。
