角膜瘘的鉴别诊断要根据其临床表现和病史进行综合分析。常见的鉴别诊断有以下几种：

1.溃疡：角膜瘘是一种完整性破坏的病症，而角膜溃疡较小，结构基本完好。角膜瘘在发生时会有较剧烈的疼痛和分泌物，而角膜溃疡较轻微。

2.噪音性小分泌物：角膜瘘分泌物为细丝状或水样，而噪音性小分泌物较粘稠。

3.眼外伤：病人个人病史、外伤的时间和方式都是判断角膜瘘和眼外伤的重要参考。角膜瘘一般不伴有外伤的病史，而眼外伤的史料比较明显。

4.眼炎：角膜瘘患者眼结膜充血、红肿等炎症症状较轻微，持续时间相对较短，而眼炎常常表现为明显的炎症症状。

上述鉴别诊断只是一些常见的症状和表现，具体参照医生的诊断意见进行治疗。