食管缺如的鉴别诊断主要包括影像学检查、内镜检查和生化检查等多个方面。

详细分析：

1.影像学检查：如X线摄影、胃肠道钡餐造影等。通过观察食管的形态特征和钡剂通过食管的情况，可以初步判断是否存在食管缺如。

2.内镜检查：如食管镜、胃镜等。通过内镜下的直接观察，可以准确地判断是否存在食管缺如，同时可以清楚地观察到周围组织器官的情况。

3.生化检查：通过检测血液中的生化指标，如血钙、血磷、血镁等，可以判断患者是否存在钙、磷、镁等元素缺乏，从而间接地判断是否存在食管缺如。

鉴别诊断食管缺如需要综合运用多个方面的检查手段，以便更加准确地进行诊断和预防。