肾结石引起的肾功能衰竭大多数是肾后性肾衰竭，一侧肾结石会引起一侧肾脏肾积水和进行性肾功能衰竭，双侧肾结石或者独立肾的肾结石才会引起肾梗阻，严重时发展为肾功能不全。治疗主要是大量饮水、调节饮食、多做运动，应用排石药物治疗，直径＜0.6cm以下的结石可能排出。结石引起肾梗阻发作时，疼痛可能比较严重，可以用止疼、解痉药物。发现感染和梗阻时需要控制感染，缓解疼痛，必要时可行输尿管插管或肾盂造瘘手术，彻底治疗肾结石。

治疗期间还可以服用中药治疗，应用清热解毒、排石药物，比如金钱草、海金沙、砂仁、薏仁、车前子、石苇。治疗时消炎药可以选用头孢类、沙星类药物，改善患者感染状况。