慢性腹痛的治疗方法有病因治疗、药物治疗或手术治疗。

具体如下：

病因治疗。根据不同的病因采取不同的治疗方法。例如，上消化道酸相关性疾病主要采用酸抑制、胃黏膜保护和抗幽门螺杆菌治疗；肺结核可能性较高时应进行诊断性抗结核治疗；结肠息肉引起的出血和腹痛，可考虑先行内镜息肉切除术等。

药物治疗。根据病情选择适当的药物，如功能性消化不良应避免引起症状加重的食物和药物，对以疼痛为主要症状的患儿，可用组胺受体拮抗剂和PPI抑酸等。

手术治疗。如巨大息肉且内镜下不能切除，可考虑腹腔镜或开腹手术。