肛门异位是一种罕见的疾病，通常是由于胚胎发育期间某些异常引起的。肛门异位的原因主要有两个方面。

胚胎发育期间的异常是引起肛门异位的主要原因之一。在正常情况下，胚胎发育过程中，肛门与直肠会在一定位置上相连接，以便排泄体内的废物。然而，如果在胚胎发育期间出现了异常，如子宫内环境不良或染色体畸变等因素，可能会导致肛门与直肠的连接异常，最终导致肛门异位的发生。

另外，遗传因素也是肛门异位的一个重要原因。某些家族中存在肛门异位的病史，说明这种疾病可能与遗传有关。遗传因素可能会导致胚胎发育过程中的异常变化，从而引起肛门异位的出现。

肛门异位的发生主要是由于胚胎发育过程中的异常以及遗传因素造成的。了解肛门异位的引起原因，对于预防和治疗这种罕见疾病非常重要。医学界需要进一步研究，以便找到更好的预防和治疗方法来帮助那些受到这种疾病困扰的患者。