食管过短是由于出生时食管发育异常或后天受到疾病、手术等影响导致的。以下是详细分析：

1.先天性异常：在胚芽发育时，食管没有完全分离成两个独立的管道，导致食管长度较短。这种情况有时伴随着其他的畸形，如食管闭锁等。

2.疾病影响：疾病可能影响到食管的正常发育和长度增长，如消化道先天性疾病（如食管闭锁、食管裂孔疝等）、胃食管反流病、食管狭窄、原发性食管癌等。

3.手术影响：食管手术（如食管癌切除术、贲门成形术等）可能导致食管长度缩短或位置改变，从而形成食管过短。

食管过短将使上段胃部内脏下垂，贲门位于胸腔一侧，形成胸腔食管疝或胃食管反流。持续胃食管反流可引起食管狭窄和炎症等后遗症。因此，当出现上腹部疼痛、反酸、吞咽困难等症状时，应及时就医做进一步的检查和治疗。