近视激光手术过程中通常不会感到明显疼痛，术前会使用表面麻醉眼药水。手术时间短且多数人仅轻微不适，术后可能出现短暂异物感或流泪。
近视激光手术采用表面麻醉，角膜表面滴入麻醉眼药水后，切削角膜时不会产生痛觉。手术器械会使用开睑器固定眼皮，过程中可能感受到器械接触眼部的压力，但属于可耐受范围。全飞秒手术通过激光在角膜基质层制作透镜，切口仅2-4毫米；半飞秒手术需制作角膜瓣，两者均无痛感。术后麻醉消退后，部分人会出现眼部酸胀、畏光，类似睫毛掉入眼睛的刺激感，这些反应多在6-12小时内缓解。医生会开具人工泪液和消炎眼药水帮助恢复，如氧氟沙星滴眼液、玻璃酸钠滴眼液等。
极少数情况下，术中因患者眼球突然转动可能导致轻微刺痛，此时医生会追加麻醉。术后若持续剧烈疼痛超过24小时，需警惕角膜瓣移位或感染，应立即复查。高度近视者角膜较薄，术后干眼症状可能更明显，需严格按医嘱使用环孢素滴眼液等药物。有瘢痕体质或角膜疾病者术前需全面评估，这类人群术后不适感可能延长。
术后需避免揉眼、游泳及长时间用眼，外出佩戴防紫外线眼镜。定期复查角膜愈合情况，术后1周内避免化妆，1个月内禁止剧烈运动。选择正规医疗机构进行详细术前检查，排除圆锥角膜等禁忌证，可最大限度降低术后不适风险。