眼底筛查一般没有危害，属于安全无创的检查方式。眼底筛查主要通过光学仪器观察视网膜、视神经等结构，有助于早期发现青光眼、糖尿病视网膜病变等疾病。
眼底筛查过程中使用的设备如眼底照相机、光学相干断层扫描仪等均不会直接接触眼球，仅通过光线反射成像。检查前可能需滴散瞳药水以扩大瞳孔，部分人会出现短暂畏光或视物模糊，通常在4-6小时内自行恢复。散瞳药物安全性较高，罕见情况下可能诱发急性闭角型青光眼发作，但概率极低。检查过程中仪器光源强度严格控制在安全范围内，不会对视网膜造成热损伤或光化学损伤。
极少数特殊人群需注意潜在风险。闭角型青光眼未确诊患者散瞳可能诱发眼压升高，需提前告知医生病史。严重干眼症或角膜疾病患者接触检查仪器时可能产生轻微刺激感。对散瞳药物过敏者可能出现眼睑红肿等过敏反应，但临床发生率不足千分之一。婴幼儿或认知障碍者可能因配合度差导致检查时间延长，但不会造成器质性损害。
建议筛查前向医生详细说明眼部病史和药物过敏史。检查后出现持续眼痛、视力下降超过24小时需及时就诊。日常注意控制血糖血压，戒烟限酒，每年定期复查眼底，尤其是有高度近视或糖尿病家族史者。避免在强光环境下用眼，筛查当日建议佩戴墨镜防护。