荷兰豆一般不建议与富含草酸的食物、高脂肪食物、寒性食物、高鞣酸食物及部分药物同食，可能影响营养吸收或引发胃肠不适。
荷兰豆与菠菜、竹笋等草酸含量高的食物同食时，草酸易与荷兰豆中的钙结合形成草酸钙沉淀，长期如此可能增加肾结石风险。荷兰豆本身富含膳食纤维，若搭配油炸食品、肥肉等高脂食物，会加重消化负担，导致腹胀或腹泻。螃蟹、苦瓜等寒性食材与荷兰豆同食可能刺激脾胃虚弱者出现腹痛。茶叶、柿子中的鞣酸会与荷兰豆的蛋白质结合产生不易消化的沉淀物，影响蛋白质吸收。服用铁剂或钙剂时食用荷兰豆，其中的植酸可能干扰矿物质吸收，降低药效。
荷兰豆与部分海鲜如牡蛎同食，少数体质敏感者可能出现组胺反应，引发皮肤瘙痒。生荷兰豆含皂苷和植物血球凝集素，若未彻底煮熟便与生冷食物同食，可能诱发呕吐或神经毒性反应。糖尿病患者同时大量摄入荷兰豆与降糖药物，可能增强药效导致低血糖。痛风患者合并食用荷兰豆与动物内脏等高嘌呤食物，可能加剧尿酸升高。特殊情况下荷兰豆与某些抗生素同服，可能影响药物代谢速度。
建议烹饪荷兰豆前焯水以减少草酸和抗营养因子，搭配胡萝卜、木耳等温性食材更利于营养均衡。消化功能较弱者应控制单次食用量在100克以内，避免与刺激性食物同餐。若需服用铁剂或钙剂，建议间隔2小时再食用荷兰豆。储存时置于阴凉通风处可延缓维生素C流失，发芽的荷兰豆须彻底加热至失去生涩味。出现腹痛、皮疹等不适症状应及时就医，过敏体质者初次尝试荷兰豆需观察反应。