空腹吃荔枝可能引发低血糖反应，严重时可导致荔枝病。荔枝含有次甘氨酸A和亚甲基环丙基甘氨酸等成分，可能干扰人体糖代谢。
荔枝中的次甘氨酸A和亚甲基环丙基甘氨酸会抑制脂肪酸氧化和糖异生过程，导致肝脏无法及时补充血糖。儿童空腹大量食用未成熟荔枝后可能出现面色苍白、冷汗、头晕等低血糖症状，严重时出现抽搐、昏迷。未完全成熟的荔枝中这两种物质含量更高，空腹食用风险更大。荔枝本身含糖量较高，但果糖需经肝脏转化才能被利用，无法快速缓解低血糖状态。
部分人群对荔枝中的成分更敏感，如营养不良者或肝糖原储备不足者。糖尿病患者空腹吃荔枝可能因糖代谢紊乱加重病情。荔枝病病例多发生在荔枝产区儿童群体，与连续多日空腹大量食用有关。食用前适当进食碳水化合物可降低风险，成熟荔枝去皮去核后毒素含量减少。
建议避免空腹食用荔枝，特别是未成熟荔枝，儿童每次食用不超过5颗为宜。食用荔枝前后可适量进食面包、米饭等主食，出现心慌、出汗等低血糖症状时立即口服葡萄糖水或糖果。荔枝不宜与降糖药物同服，慢性病患者及孕妇食用前应咨询医生。储存荔枝时注意通风避免发酵产毒，变质荔枝不可食用。日常饮食需保证碳水化合物摄入，避免长时间空腹状态。