扇贝不宜与寒性食物、高鞣酸食物、高草酸食物、高嘌呤食物及酒精类饮品同食，可能引发胃肠不适或影响营养吸收。
扇贝属于高蛋白海鲜，与寒性食物如西瓜、苦瓜等同食易导致腹泻。其富含的钙质与高鞣酸食物如浓茶、柿子结合会形成沉淀物，降低营养价值。与菠菜、竹笋等高草酸食物同食可能增加结石风险。搭配啤酒、动物内脏等高嘌呤食物可能诱发痛风。酒精会抑制扇贝中嘌呤代谢，加重肝肾负担。建议烹饪时搭配姜蒜等温性调料中和寒性，间隔2小时再食用上述禁忌食物。
日常食用扇贝需确保新鲜并充分加热，过敏体质者应谨慎尝试。可搭配山药、胡萝卜等健脾食材提升吸收率，避免与寒凉饮品同服。若出现恶心、皮疹等不适症状应立即停食并就医。储存时须冷冻保存，烹调前彻底解冻，避免反复冻融。儿童及孕妇食用应控制单次摄入量在50克以内，慢性病患者需咨询营养师制定个性化膳食方案。