颅内感染多数情况下可以治愈，但具体预后与感染类型、治疗时机及患者基础健康状况有关。常见治疗方式包括抗生素治疗、抗病毒治疗、手术引流及对症支持治疗。
细菌性脑膜炎、病毒性脑炎等常见颅内感染在早期规范治疗下，多数患者可完全康复。细菌性感染需根据病原学检查结果选择敏感抗生素，如头孢曲松钠注射液、美罗培南注射液等，疗程通常持续2-4周。病毒性感染以阿昔洛韦注射液、更昔洛韦注射液等抗病毒药物为主，配合脱水降颅压治疗。真菌或结核性感染需延长疗程至数月，使用两性霉素B脂质体、异烟肼片等药物。
部分重症颅内感染可能遗留神经系统后遗症。化脓性脑膜炎合并脑脓肿时，需手术清除病灶；结核性脑膜炎易引起脑脊液循环障碍，需脑室腹腔分流术干预。HIV合并隐球菌性脑膜炎、免疫缺陷患者合并巨细胞病毒性脑炎等特殊感染，治愈率相对较低，需长期维持治疗。
颅内感染患者康复期需保证充足营养摄入，优先选择高蛋白食物如鱼肉、豆制品，适量补充维生素B族和抗氧化物质。卧床患者应每2小时翻身预防压疮，肢体功能障碍者需早期介入康复训练。定期复查脑脊液指标和影像学检查，监测听力、视力等神经系统功能变化。出现头痛加剧、意识模糊等症状时需立即就医。保持居住环境通风干燥，避免受凉感冒诱发感染复发。