枸杞隔夜泡水一般不建议继续饮用。枸杞泡水后若存放时间过长，可能出现细菌滋生、有效成分氧化等问题，影响饮用安全性和营养价值。
枸杞泡水后若在常温下放置超过8小时，水中糖分和营养成分会成为微生物繁殖的培养基，容易导致水质腐败变质。尤其是夏季高温环境，细菌滋生速度更快，饮用后可能引发胃肠不适。枸杞中的多糖、甜菜碱等活性成分在长时间浸泡后会发生氧化降解，抗氧化能力显著下降。实验显示，枸杞浸泡12小时后维生素C损失率较高，类胡萝卜素等脂溶性成分也会因水相环境而析出减少。
若将枸杞水密封冷藏保存，在4℃环境下可延缓微生物繁殖，8小时内饮用相对安全。但冷藏无法完全阻止营养成分的流失，枸杞中的酚类物质仍会持续氧化。部分人群误以为隔夜枸杞水颜色变深是有效成分溶出更充分，实际是酚类物质氧化聚合的结果。使用保温杯长时间闷泡会加速这一过程，并可能析出容器中的重金属物质。
建议每次冲泡枸杞时控制用量在10-15粒，用60-80℃温水冲泡后2小时内饮用完毕。可使用透明玻璃杯观察水质变化，若出现絮状沉淀或明显酸味应立即停止饮用。日常保存枸杞应置于阴凉干燥处，开封后建议1个月内用完。搭配菊花、决明子等药材冲泡时更需现泡现饮，避免成分相互作用产生变化。特殊人群如糖尿病患者需注意枸杞摄入量，妊娠期女性饮用前应咨询医师意见。