吸烟会加重扁桃体炎症状并延缓恢复。烟草中的有害物质可直接刺激扁桃体黏膜，导致炎症反复发作或迁延不愈。
烟草燃烧产生的焦油和尼古丁会破坏扁桃体表面纤毛的清洁功能，使病原体更易附着繁殖。长期吸烟者的扁桃体隐窝内常积聚烟碱残留物，形成慢性炎症环境。急性发作期吸烟可能诱发剧烈咽痛，咳嗽时疼痛放射至耳部。被动吸烟同样会刺激儿童扁桃体增生，表现为夜间打鼾和吞咽不畅。临床观察发现戒烟后患者扁桃体充血程度可减轻，抗生素治疗有效率提升。
部分合并胃食管反流的吸烟者，夜间平卧时胃酸与烟雾双重刺激会导致扁桃体溃疡。免疫抑制患者吸烟可能诱发扁桃体周围脓肿，需切开引流。电子烟产生的气溶胶虽不含焦油，但丙二醇和香料仍会引发淋巴组织增生。特殊职业如矿工、焊工等叠加粉尘刺激时，吸烟者易发展为慢性扁桃体炎。妊娠期吸烟可能通过胎盘影响胎儿扁桃体发育，增加后代呼吸道感染风险。
扁桃体炎患者应严格戒烟并避免二手烟环境，每日用生理盐水漱口3-5次保持口腔清洁。饮食选择温凉流质食物如米汤、藕粉，避免辛辣刺激及过硬食物摩擦发炎部位。保证每日2000毫升饮水促进毒素排出，睡眠时垫高床头减少咽喉部充血。恢复期可适量食用雪梨、枇杷等润喉食物，但糖尿病患需控制水果摄入量。出现持续发热、张口困难或颈部淋巴结肿大时应及时耳鼻喉科就诊，必要时进行咽拭子培养指导用药。