鱼腥草根具有清热解毒、利尿消肿、抗菌消炎等功效，主要用于治疗肺热咳嗽、泌尿系统感染、皮肤炎症等疾病。
1、清热解毒
鱼腥草根含有鱼腥草素等活性成分，能有效清除体内热毒，缓解咽喉肿痛、口腔溃疡等症状。对于风热感冒初期出现的发热、头痛，可用鲜品捣汁含漱或煎汤内服。
2、利尿消肿
其钾盐和槲皮苷成分能促进钠离子排泄，改善水肿症状。对急慢性肾炎导致的下肢浮肿，可配伍玉米须煎服，但肾功能不全者慎用。
3、抗菌消炎
鱼腥草素对金黄色葡萄球菌、流感杆菌等有抑制作用。临床常用鱼腥草注射液治疗肺炎，外用可缓解湿疹渗液，需避免接触眼部黏膜。
4、增强免疫
多糖成分能激活巨噬细胞吞噬功能，提高呼吸道黏膜防御能力。易感冒人群可定期饮用鱼腥草茶，但虚寒体质者不宜长期服用。
5、抗病毒
对流感病毒、单纯疱疹病毒有抑制效果，疫情期间可用作预防性食疗。治疗带状疱疹时可鲜品捣敷患处，出现皮肤过敏应立即停用。
使用鱼腥草根时建议选择新鲜无霉变植株，虚寒体质者应配伍生姜红枣调和药性。日常可制作凉拌鱼腥草根或煮水代茶，连续服用不宜超过两周。出现食欲减退、腹泻等不良反应需停用，孕妇及婴幼儿使用前应咨询中医师。储存时需保持干燥通风，避免与有毒植物混放。