种牙一般不会直接导致牙龈萎缩，但若术后护理不当或存在牙周疾病等风险因素，可能间接引发牙龈萎缩。
种植牙手术本身通过将人工牙根植入牙槽骨实现修复，规范操作不会损伤牙龈组织。术后牙龈萎缩多与患者自身牙周健康状况相关，例如术前存在慢性牙周炎未彻底控制，或术后口腔卫生不良导致种植体周围炎，可能造成牙龈退缩。种植体位置偏差、咬合力过大等机械刺激也可能加速局部牙龈萎缩。
少数情况下，若患者存在全身性疾病如糖尿病未控制，或长期服用影响骨代谢的药物，可能影响种植体周围组织的愈合能力，增加牙龈萎缩风险。吸烟者的牙龈微循环障碍也会提高术后并发症概率。
为预防种植牙后牙龈萎缩，建议术前完善牙周治疗并控制全身性疾病，术后严格遵循医嘱使用软毛牙刷及牙线清洁种植体周围，每半年接受专业洁治和种植体维护，避免吸烟及过硬食物。出现牙龈红肿、出血等症状时需及时复诊，必要时通过软组织移植等手术修复萎缩的牙龈。