病毒性扁桃体炎具有传染性，主要通过飞沫或接触传播。病毒性扁桃体炎主要由腺病毒、流感病毒、EB病毒等病原体感染引起，患者需注意隔离防护。
病毒性扁桃体炎的传染源为患者及隐性感染者，病原体可通过咳嗽、打喷嚏产生的飞沫传播，也可通过接触被污染的餐具、毛巾等物品间接传播。发病初期传染性较强，常见于免疫力低下人群或儿童。病毒侵入人体后潜伏期为2-4天，随后出现咽痛、发热、扁桃体充血等症状。预防措施包括佩戴口罩、勤洗手、避免共用餐具等。若家庭成员患病，建议分室居住并对接触物品进行消毒处理。
少数情况下，EB病毒引起的传染性单核细胞增多症可能伴随脾肿大、淋巴结肿大等全身症状，此时传染期可延长至数周。免疫功能缺陷者或孕妇感染后可能出现严重并发症，需加强防护。医院内传播风险较高，探视患者时应做好个人防护。
病毒性扁桃体炎患者应单独使用餐具并定期煮沸消毒，咳嗽时用肘部遮挡口鼻，患病期间避免前往人群密集场所。保持室内通风换气，每日开窗2-3次，每次30分钟以上。康复后可适当补充维生素C含量高的水果如猕猴桃、橙子等，有助于黏膜修复。建议密切接触者观察1周，出现咽部不适及时就医。日常可通过盐水漱口、保证充足睡眠等方式增强抵抗力。