幽门螺杆菌感染患者服用益生菌可能有一定辅助作用，但无法替代正规药物治疗。益生菌主要通过调节肠道菌群平衡、抑制幽门螺杆菌定植等机制发挥作用。
部分临床研究显示，特定益生菌株如布拉氏酵母菌、鼠李糖乳杆菌等可降低幽门螺杆菌在胃黏膜的黏附能力，减轻抗生素治疗引起的腹泻等不良反应。这类益生菌能竞争性抑制幽门螺杆菌生长，同时增强胃黏膜屏障功能。但益生菌对幽门螺杆菌的根除率有限，单独使用难以达到理想效果。
少数情况下，患者因对抗生素耐药或存在用药禁忌时，医生可能建议短期使用益生菌作为过渡方案。但这种情况需严格监测疗效，且通常需要配合其他非抗生素疗法如铋剂等。益生菌对儿童、孕妇等特殊人群的安全性数据尚不充分，需谨慎评估风险收益比。
幽门螺杆菌感染者应在医生指导下规范使用四联疗法等药物治疗方案，可酌情配合特定益生菌制剂辅助治疗。日常饮食需避免辛辣刺激食物，规律进餐并保持餐具消毒。治疗期间定期复查碳13/14呼气试验，确认根除效果。若出现严重腹痛、黑便等症状需及时复诊调整方案。