益生菌对幽门螺杆菌感染可能有一定辅助作用，但无法替代标准药物治疗。幽门螺杆菌感染通常需采用抗生素联合疗法，益生菌可能通过调节肠道菌群、抑制细菌定植等方式减轻症状。
部分研究发现特定益生菌株如乳酸菌、双歧杆菌等可能抑制幽门螺杆菌生长，其机制包括竞争性抑制细菌黏附、分泌抗菌物质等。临床中常用布拉氏酵母菌散、双歧杆菌三联活菌胶囊等辅助治疗，可能缓解抗生素引起的腹泻等不良反应。但益生菌单独使用根除率极低，国际共识仍推荐以质子泵抑制剂联合两种抗生素为主的标准四联疗法。不同菌株效果差异较大，鼠李糖乳杆菌、罗伊氏乳杆菌等特定菌株可能更具针对性。使用时应选择标注菌株编号的产品，并与抗生素间隔2小时服用以避免相互影响。
幽门螺杆菌感染者应在医生指导下规范用药，可配合益生菌调节胃肠功能。治疗期间避免辛辣刺激食物，适量补充富含维生素C的蔬菜水果如西蓝花、猕猴桃等，有助于胃黏膜修复。日常注意分餐制预防交叉感染，完成疗程后需复查确认根除效果。若出现持续腹痛、黑便等症状应及时复诊，不建议自行长期服用益生菌替代正规治疗。