长期饮用沉香茶一般无明显副作用，但过量饮用可能引起胃肠不适或药物相互作用。沉香茶是以沉香木为主要原料的饮品，具有行气止痛、温中止呕等功效。
沉香茶中的活性成分如沉香醇、沉香四醇等具有抗炎和镇静作用，适量饮用有助于缓解焦虑或轻度胃肠胀气。冲泡时建议使用3-5克沉香木片，每日饮用1-2杯为宜，避免空腹饮用。沉香茶可能影响抗凝药物代谢，服用华法林钠片、利伐沙班片等抗血栓药物者需谨慎。部分人群饮用后可能出现口干、轻微头晕等反应，通常停止饮用后即可缓解。沉香茶不宜替代药物治疗，慢性疾病患者应咨询医生后饮用。
建议饮用沉香茶时控制每日摄入量，避免与浓茶或咖啡同时饮用，出现不适症状应立即停用。孕妇、哺乳期妇女及肝肾功能异常者应在医师指导下饮用，储存时需放置阴凉干燥处防止霉变。日常可搭配陈皮、玫瑰花等理气药材增强功效，但不宜与寒凉性中药同服。饮用期间注意观察排便情况，如出现腹泻需调整用量，长期饮用者建议每3个月进行健康评估。