食管癌容易与反流性食管炎、贲门失弛缓症、食管良性肿瘤、食管结核、食管裂孔疝等疾病混淆。这些疾病在临床表现上与食管癌存在相似之处，需通过胃镜、病理活检等检查进行鉴别诊断。
1、反流性食管炎
反流性食管炎是因胃酸反流至食管引起的炎症，主要表现为胸骨后烧灼感、反酸、吞咽疼痛等症状，与早期食管癌症状相似。但反流性食管炎症状多呈间歇性，可通过抑酸药物缓解，胃镜下可见食管黏膜充血糜烂而无肿块。确诊需结合24小时食管pH监测。
2、贲门失弛缓症
贲门失弛缓症是食管下括约肌功能障碍性疾病，典型表现为吞咽困难、食物反流及胸骨后疼痛，易被误诊为食管癌。但该病病程较长且症状波动明显，钡餐检查可见食管扩张伴鸟嘴样狭窄，食管测压可发现括约肌压力异常增高。
3、食管良性肿瘤
食管平滑肌瘤、食管息肉等良性肿瘤也可引起吞咽梗阻感，但病程进展缓慢。胃镜下可见黏膜下隆起但表面光滑，超声内镜能明确肿瘤来源层次，病理活检无恶性细胞可鉴别。
4、食管结核
食管结核多继发于肺结核，表现为吞咽疼痛、低热、消瘦等，与食管癌消耗症状类似。但结核患者多有结核病史，内镜下可见多发溃疡伴干酪样坏死，结核菌素试验阳性，抗结核治疗有效。
5、食管裂孔疝
食管裂孔疝因胃部疝入胸腔导致胸骨后疼痛、反酸等症状，需与食管癌鉴别。该病症状多与体位相关，钡餐造影可见胃底位于膈肌上方，胃镜检查无食管占位性病变。
对于出现持续性吞咽困难、消瘦等症状的患者，建议尽早就医完善胃镜及病理检查。日常应避免进食过快、过烫食物，戒烟限酒，规律作息。若确诊为上述良性疾病，需遵医嘱规范治疗并定期复查；若高度怀疑食管癌，则需通过增强CT、PET-CT等进一步评估分期。