打肝素后仍可能发生胎停，但概率较低。肝素主要用于预防血栓形成，降低因胎盘血流不足导致的胎停风险，但无法完全避免其他因素引起的胎停。
肝素通过抗凝作用改善胎盘微循环，对血栓前状态、抗磷脂抗体综合征等引起的胎停有明确预防效果。这类患者规范使用肝素可显著降低胎停概率。但胎停还可能由染色体异常、子宫结构畸形、内分泌紊乱、感染等因素引起，肝素对这些原因无直接干预作用。若存在上述非血栓性因素，即使使用肝素仍可能发生胎停。
极少数情况下，肝素使用不当可能导致出血倾向或血小板减少，反而增加妊娠风险。需严格监测凝血功能，调整剂量。母体合并严重基础疾病如未控制的糖尿病、高血压等，也可能抵消肝素的保护作用。
使用肝素期间应定期复查超声观察胚胎发育，配合监测凝血功能及血小板计数。同时需排查其他胎停高危因素，如甲状腺功能、糖耐量、TORCH感染等。保持规律作息，避免剧烈运动和外伤，出现阴道流血或腹痛及时就医。饮食注意补充富含铁和维生素K的食物，但需与用药时间间隔2小时以上。