打肝素后仍可能发生胎停，但概率较低。肝素主要用于预防血栓形成，降低因胎盘供血不足导致的胎停风险，但无法完全避免其他因素引起的胎停。
肝素通过抗凝血作用改善胎盘微循环，对血栓前状态、抗磷脂抗体综合征等引起的胎停有明确预防效果。这类情况下胎停概率可显著降低。但肝素无法干预胚胎染色体异常、子宫结构畸形、内分泌紊乱或感染等因素导致的胎停。若存在上述问题，即使规范使用肝素仍可能发生不良妊娠结局。
极少数情况下，肝素使用不当可能增加出血风险，反而影响胎盘功能。用药期间需定期监测凝血功能，避免过量或不足。同时合并其他高危因素时，需联合免疫调节、黄体支持等综合治疗才能进一步降低胎停风险。
使用肝素期间应遵医嘱定期复查超声及凝血指标，避免剧烈运动以防出血。保持均衡饮食，适量补充维生素D和叶酸，避免高脂高糖饮食加重血液高凝状态。出现阴道流血、腹痛或胎动异常需立即就医。心理疏导同样重要，焦虑情绪可能通过神经内分泌途径影响妊娠，建议通过正念冥想等方式缓解压力。