使用肝素后仍发生胎停可能与母体凝血异常未完全纠正、胚胎染色体异常、免疫因素未控制等因素有关。肝素主要用于预防血栓形成，但无法干预其他导致胎停的病理机制。
肝素通过抗凝血作用降低胎盘血栓形成风险，但对胚胎染色体异常、母体免疫紊乱等非血栓因素无直接干预效果。部分患者存在抗磷脂抗体综合征等疾病，单纯肝素治疗可能不足以维持妊娠。胚胎自身发育异常是早期胎停的常见原因，与肝素使用无关。子宫动脉血流阻力增高时，肝素改善血流的效果可能有限。某些遗传性血栓倾向患者需要更高剂量肝素或联合用药。
极少数情况下存在肝素抵抗现象，血液中肝素浓度达不到治疗要求。合并未控制的糖尿病或甲状腺疾病也会增加胎停风险。部分患者存在未被诊断的子宫畸形或感染因素。个别对肝素代谢异常的患者可能需要监测抗凝血因子活性。某些免疫因素如自然杀伤细胞活性过高需要配合免疫调节治疗。
建议有胎停史的孕妇在医生指导下完善凝血功能、免疫抗体、染色体等全面检查，孕期定期监测子宫动脉血流和胚胎发育情况，根据检查结果调整抗凝方案，必要时联合使用阿司匹林、免疫球蛋白等药物，同时注意控制基础疾病，保持规律作息和均衡营养，避免接触有毒有害物质。