男性小便流脓可能由淋病奈瑟菌感染、非淋菌性尿道炎、前列腺炎、尿路结石或泌尿系统结核等原因引起，需通过病原体检测、影像学检查等方式确诊。
1、淋病奈瑟菌感染
淋病奈瑟菌感染引起的尿道炎表现为黄色脓性分泌物，常伴有尿痛和尿道口红肿。发病与不洁性接触有关，需进行分泌物涂片镜检确诊。治疗可选用注射用头孢曲松钠、阿奇霉素片等药物，同时须对性伴侣进行同步治疗。
2、非淋菌性尿道炎
主要由沙眼衣原体或解脲支原体感染导致，分泌物呈白色稀薄脓液，可能伴随轻微尿频。可通过核酸扩增试验检测病原体，常用盐酸多西环素片、阿奇霉素分散片等药物治疗，治疗期间应避免性行为。
3、前列腺炎
急性细菌性前列腺炎可出现会阴部胀痛伴尿道脓性分泌物，可能与尿路逆行感染相关。直肠指检可触及肿大前列腺，治疗需选用穿透前列腺包膜较好的药物如左氧氟沙星片、盐酸坦索罗辛缓释胶囊等。
4、尿路结石
结石嵌顿合并感染时可能引发脓尿，多伴有腰腹部绞痛和血尿。超声或CT可明确结石位置，需根据结石大小选择体外冲击波碎石或输尿管镜取石术，同时使用注射用头孢哌酮钠舒巴坦钠控制感染。
5、泌尿系统结核
结核分枝杆菌感染可导致慢性脓尿，常合并低热、盗汗等全身症状。尿抗酸染色和结核菌素试验有助于诊断，需规范使用异烟肼片、利福平胶囊等抗结核药物，疗程通常持续6-9个月。
出现小便流脓症状应立即停止性生活，避免辛辣刺激饮食，每日饮水2000毫升以上促进排尿冲刷尿道。内裤需每日更换并用沸水消毒，治疗期间禁止饮酒。若伴有发热或腰痛需急诊处理，所有药物均须在医生指导下规范使用，完成全程治疗后方可复查评估疗效。