男性小便时尿道刺痛流脓可能由淋菌性尿道炎、非淋菌性尿道炎、前列腺炎、尿路感染、尿道结石等原因引起，可通过抗生素治疗、对症处理、生活方式调整等方式改善。建议及时就医明确诊断。
1、淋菌性尿道炎
淋菌性尿道炎由淋病奈瑟菌感染引起，表现为尿道口流脓伴排尿灼痛。需通过分泌物涂片或培养确诊，常用注射用头孢曲松钠、盐酸大观霉素注射液等药物治疗。治疗期间禁止性生活，性伴侣需同步检查。
2、非淋菌性尿道炎
主要由沙眼衣原体或解脲支原体感染导致，症状较淋病轻但病程更长。可口服阿奇霉素片、盐酸多西环素片等药物，需完成全程治疗。未治愈前避免饮酒及辛辣饮食。
3、前列腺炎
急性细菌性前列腺炎可出现尿道脓性分泌物，伴随会阴部胀痛。需使用左氧氟沙星片、甲硝唑片等穿透前列腺包膜的药物。慢性患者可配合温水坐浴缓解症状。
4、尿路感染
大肠杆菌等致病菌上行感染时，除排尿刺痛外可能出现血尿。轻症可用磷霉素氨丁三醇散，重症需静脉输注注射用哌拉西林钠他唑巴坦钠。每日饮水2000毫升以上有助于冲刷尿道。
5、尿道结石
结石移动划伤尿道黏膜时可能继发感染，出现脓尿伴剧烈绞痛。小于6毫米的结石可通过口服盐酸坦索罗辛缓释胶囊促进排出，较大结石需体外冲击波碎石。
出现尿道流脓症状期间应保持会阴清洁，每日更换内裤并用沸水烫洗。饮食宜清淡，避免咖啡因及酒精刺激。治疗期间禁止性生活，症状消失后需复查确认病原体清除。合并发热或腰腹痛需急诊处理，防止感染扩散至肾脏。长期反复发作建议检查免疫功能及泌尿系统结构异常。