男性尿道流脓伴随小便刺痛通常是泌尿系统感染的典型表现，可能由淋病奈瑟菌、衣原体等病原体感染引起，属于需及时干预的病情。
尿道流脓和小便刺痛最常见于淋菌性尿道炎或非淋菌性尿道炎。淋菌性尿道炎脓液常呈黄绿色且量多，排尿时灼痛感明显，可能伴有尿道口红肿。非淋菌性尿道炎多为白色稀薄分泌物，排尿不适感相对较轻，但可能合并会阴部坠胀。两类感染均可通过性接触传播，未规范治疗可能引起附睾炎、前列腺炎等并发症。急性期需避免性生活，保持会阴清洁干燥，每日更换内裤并用沸水烫洗。
少数情况下症状可能与泌尿系结核或尿道异物有关。泌尿系结核患者可能出现午后低热、夜间盗汗等全身症状，脓尿呈米汤样，需结合影像学检查确诊。尿道异物则多见于青少年，有异物插入史，可能伴随血尿或排尿中断现象。这类情况需通过膀胱镜或CT等检查明确病因，单纯抗感染治疗无效。
建议立即至泌尿外科或皮肤性病科就诊，通过分泌物涂片、尿培养等检查明确病原体。治疗期间禁止饮酒及辛辣饮食，每日饮水2000毫升以上促进排尿冲洗尿道。性伴侣需同步检查治疗，治愈前避免无保护性行为。完成抗生素疗程后应复查确保病原体清除，防止转为慢性感染。