膀胱镜检查通常会有轻微不适感，但多数女性可以耐受。检查过程中的疼痛程度与个体敏感度、医生操作技术以及是否使用麻醉等因素有关。
膀胱镜检查时，医生会将一根细长的内窥镜经尿道插入膀胱。尿道黏膜分布有神经末梢，器械通过时可能引发胀痛或灼热感，类似排尿刺痛。现代膀胱镜直径较细且表面光滑，配合局部麻醉凝胶的使用，能显著降低不适感。检查过程中保持放松、避免紧张性肌肉收缩也有助于减轻疼痛。
少数对疼痛极度敏感或存在尿道狭窄的女性可能体验较明显痛感。既往有泌尿系统手术史、慢性尿道炎或盆底肌痉挛的患者，检查前需主动告知医生。部分医院提供静脉镇静麻醉选项，适合心理恐惧强烈或预估操作难度较大的情况。
检查前2小时建议排空膀胱但不憋尿，穿着宽松衣物方便检查。术后24小时内可能出现排尿轻微刺痛或淡红色尿液，属正常现象，可通过多饮水冲洗尿道缓解。若出现持续血尿、发热或剧烈疼痛需及时就医。日常注意会阴清洁，避免久坐和辛辣饮食，有助于维持泌尿系统健康。检查后1-2天避免剧烈运动和性生活，防止黏膜损伤处继发感染。