孕35天药流一般能流干净，但存在少数不完全流产的情况。药物流产适用于妊娠49天内的早期妊娠，孕35天时胚胎较小，药物作用较充分。不完全流产可能与个体对药物敏感性、胚胎着床位置等因素有关。
药物流产通过米非司酮和米索前列醇的联合作用终止妊娠。米非司酮阻断孕激素受体使胚胎停止发育，米索前列醇促进子宫收缩排出妊娠组织。孕35天时妊娠囊直径通常不足2厘米，子宫蜕膜组织较薄，药物容易发挥作用。临床数据显示大部分女性可在服药后6小时内完成妊娠组织排出，阴道出血量类似月经且逐渐减少。
少数情况下可能出现药流不全，表现为持续阴道出血超过2周、出血量突然增多或伴有剧烈腹痛。这可能与药物吸收差异、子宫位置异常或胚胎着床于子宫角部有关。药流后需复查超声确认宫腔内无残留组织，若发现残留需根据情况选择清宫手术或药物保守治疗。
药流后需卧床休息1-3天，避免剧烈运动和重体力劳动。保持会阴清洁，每日用温水清洗外阴，2周内禁止盆浴和性生活。观察阴道出血情况，记录出血量和持续时间。饮食宜清淡易消化，适量补充含铁食物如瘦肉、动物肝脏等预防贫血。药流后10-14天必须复查超声，期间出现发热、腹痛加剧或出血量超过月经量需立即就医。药流后卵巢功能通常在下个月经周期恢复，但建议避孕3-6个月后再计划妊娠。