49天内药流通常可以流干净，但存在少数不完全流产的情况。药物流产适用于妊娠49天内的早期妊娠，通过药物促使子宫收缩排出妊娠组织。若孕囊排出不完全或出血异常，需及时就医处理。
药物流产的成功率与妊娠天数密切相关。妊娠35天内进行药流，完全流产率较高，孕囊通常能完整排出。妊娠35-49天时，随着胚胎发育，可能出现蜕膜残留或孕囊排出不全，需超声复查确认。药流后阴道出血一般持续1-3周，若出血量超过月经量或持续超过3周，提示可能存在宫腔残留。
少数情况下，药流后会发生不完全流产，常见于子宫位置异常、多次妊娠史或药物吸收不良者。这类人群可能出现剧烈腹痛、发热或大出血，需紧急清宫手术。药流后10-14天必须复查超声，确认宫腔内无残留组织。既往有剖宫产史者更易发生子宫瘢痕处妊娠组织残留。
药流后应卧床休息2-3天，避免体力劳动和剧烈运动。保持会阴清洁，每日用温水清洗外阴，禁止盆浴和性生活1个月。观察出血情况，记录卫生巾使用数量，发现组织物排出可保留送检。饮食宜清淡，多摄入含铁食物如动物肝脏、菠菜等，预防贫血。按医嘱服用抗生素和促宫缩药物，禁止自行服用活血化瘀类中药。若出现发热、腹痛加剧或出血量突然增多，须立即返院就诊。