40天左右的药物流产多数情况下可以流干净，但存在少数不完全流产的可能。药物流产的成功概率与孕囊大小、子宫位置、个体对药物的敏感性等因素有关。
药物流产适用于妊娠49天内的早期终止妊娠，40天左右属于较理想的时间范围。孕囊较小且子宫收缩良好时，药物可促使孕囊完整排出，出血量通常在7-14天逐渐减少，超声复查显示宫腔内无残留组织。部分女性可能出现孕囊排出延迟或蜕膜残留，表现为持续出血超过两周、腹痛加重或发热，此时超声检查可见宫腔内异常回声，需考虑清宫手术干预。药物流产前后需严格遵循医嘱，服用米非司酮片和米索前列醇片需间隔特定时间，用药后需在医院观察孕囊排出情况。
少数情况下，如子宫过度前屈或后屈、孕囊着床位置异常、药物吸收不良等，可能导致流产失败或不完全流产。既往有剖宫产史、子宫肌瘤或多次流产史的群体风险更高。若用药后未见孕囊排出或出血量超过月经量两倍，应立即就医处理。药物流产后两周内禁止盆浴、性生活及剧烈运动，避免感染风险。
药物流产后应卧床休息1-3天，避免体力劳动，每日观察出血量和体温变化。饮食上增加瘦肉、动物肝脏等富含铁的食物，预防贫血，同时补充维生素C促进铁吸收。两周后复查超声确认流产效果，期间出现发热、剧烈腹痛或大出血需急诊处理。后续避孕建议采用短效避孕药或避孕套，半年内避免再次妊娠以降低子宫内膜损伤风险。