肛瘘手术后疼痛一般持续3-7天，具体时间与手术方式、个人耐受度及术后护理有关。
肛瘘手术后的疼痛程度和持续时间因人而异。传统开放式手术因创面较大，术后1-3天疼痛较明显，部分患者需使用镇痛药物。微创手术如肛瘘栓填塞术或激光手术，创伤较小，疼痛多在1-2天内缓解。术后24小时内疼痛最剧烈，随着伤口愈合逐渐减轻。排便时因肛门括约肌收缩可能加重疼痛，建议保持大便软化。术后3天左右创面开始形成新生组织，疼痛感明显下降。若疼痛持续超过7天或伴随发热、脓性分泌物，需警惕感染可能。
术后应保持肛门清洁干燥，每次排便后用温水或生理盐水清洗，避免用力擦拭。饮食选择高纤维食物如燕麦、西蓝花，每日饮水不少于2000毫升，预防便秘。避免久坐久站，可侧卧减轻肛门压力。按医嘱使用复方角菜酸酯栓、马应龙麝香痔疮膏等药物促进愈合。术后1个月内禁止剧烈运动、骑自行车等可能摩擦伤口的活动，定期复查观察愈合情况。