准分子激光近视眼手术可能出现干眼症、眩光、夜间视力下降、角膜混浊、屈光回退等副作用。手术通过激光切削角膜改变屈光度，多数副作用可随时间缓解，但需严格术前评估与术后护理。
干眼症是术后常见反应，因激光切削可能暂时影响角膜神经调节功能，表现为眼干、异物感，多数在3-6个月内逐渐恢复，需遵医嘱使用人工泪液如玻璃酸钠滴眼液缓解。眩光与夜间视力下降多与瞳孔大小或角膜切削区设计有关，暗环境下症状更明显，驾驶者需谨慎，通常6-12个月适应后减轻。角膜混浊属于较严重并发症，与个体愈合反应过强相关，可能需二次手术或激素治疗如氟米龙滴眼液干预。屈光回退多见于高度近视患者，因角膜重塑或用眼习惯不当导致，需避免过度用眼并定期复查，必要时可考虑增效手术。极少数情况下可能出现角膜感染或圆锥角膜，需立即就医处理。
术后早期需严格避免揉眼、游泳及强光刺激，按规范使用抗生素滴眼液如左氧氟沙星滴眼液预防感染。长期需注意用眼卫生，每20分钟远眺20秒，每年复查角膜地形图。选择经验丰富的手术医师、规范术前检查可显著降低风险，但个体差异仍可能导致不可预测的副作用。
术后应保持充足睡眠，避免长时间使用电子屏幕，饮食中增加富含维生素A的胡萝卜、菠菜等食物，佩戴防紫外线太阳镜保护角膜。若出现持续眼痛、视力骤降等异常症状须及时复诊，避免自行用药。术后3个月内避免剧烈运动及眼部化妆，遵医嘱定期使用抗炎滴眼液如普拉洛芬滴眼液，建立完整的术后随访记录有助于早期发现并处理并发症。