肛瘘可能引发局部感染、肛门功能受损、全身性炎症反应等危害，严重时可导致败血症或癌变风险增加。
1、局部感染
肛瘘形成的异常通道易积聚粪便和细菌，反复刺激可引发肛周脓肿。患者可能出现持续性肛门疼痛、分泌物增多伴异味，严重时局部皮肤溃烂形成多个外口。需通过肛瘘切除术或挂线疗法清除病灶，术后配合高锰酸钾坐浴预防复发。
2、肛门失禁
长期未治疗的复杂肛瘘可能损伤肛门括约肌，导致控便能力下降。典型表现为排气或排便不受控制，尤其在高位肛瘘中更常见。生物反馈训练和提肛运动可帮助改善轻度失禁，重度者需行括约肌成形术。
3、全身感染
细菌经瘘管侵入血液循环可能诱发败血症，表现为高热寒战、血压下降等全身中毒症状。实验室检查可见白细胞计数显著升高，血培养可明确致病菌。需静脉注射头孢曲松钠等广谱抗生素，必要时进行脓液引流。
4、癌变风险
超过10年的慢性肛瘘存在恶变可能，病理类型多为腺癌。患者会出现肛门肿块快速增大、出血量增加等警示症状。确诊需通过活检病理检查，治疗需采用腹会阴联合切除术配合放化疗。
5、生活质量下降
长期渗液可能引发会阴部湿疹，剧烈瘙痒影响日常活动。部分患者因反复就医产生焦虑抑郁情绪。保持局部干燥清洁，使用氧化锌软膏保护皮肤，必要时进行心理疏导干预。
肛瘘患者应避免久坐久站，每日用温水清洗肛门2次并彻底擦干，选择全棉透气内裤。饮食上增加燕麦、火龙果等富含膳食纤维的食物，限制辛辣刺激饮食。术后恢复期可进行凯格尔运动增强盆底肌力量，定期复查瘘管愈合情况，出现发热或剧烈疼痛需立即就医。