鼻窦炎通常可以手术治疗，但需根据病情严重程度、病程长短及药物疗效综合评估。手术方式主要有鼻内镜鼻窦手术、球囊扩张术等。
对于反复发作超过12周或规范药物治疗无效的慢性鼻窦炎，手术是重要治疗手段。鼻内镜手术通过微创方式清除病变黏膜和阻塞物，恢复鼻窦通气引流功能，术后需配合鼻腔冲洗和激素喷雾。合并鼻息肉、解剖结构异常或真菌性鼻窦炎的患者，手术可显著改善症状。急性鼻窦炎继发眶内或颅内并发症时，需急诊手术引流脓液。儿童鼻窦炎手术指征更严格，通常优先选择药物和保守治疗。
轻度鼻窦炎或初发急性感染阶段，一般无须手术干预。过敏体质、凝血功能障碍或严重心肺疾病患者手术风险较高。妊娠期女性除非出现严重并发症，否则应暂缓手术。术后可能出现出血、粘连、嗅觉减退等并发症，需定期复查和长期随访。
鼻窦炎患者术后应保持鼻腔湿润，避免用力擤鼻和剧烈运动，戒烟限酒，减少辛辣刺激食物摄入。日常可使用生理盐水冲洗鼻腔，注意保暖预防感冒，定期复查鼻内镜。合并过敏性鼻炎者需持续控制过敏症状，避免接触粉尘、花粉等过敏原。若出现发热、剧烈头痛或视力变化需及时就医。