慢性肾盂肾炎的确诊需结合临床表现、实验室检查和影像学检查综合判断，主要方法有尿常规检查、尿培养、肾功能检查、肾脏超声和静脉肾盂造影等。
尿常规检查可发现白细胞尿、脓尿或蛋白尿，部分患者可见镜下血尿。尿培养是确诊的关键，需连续多次中段尿培养，若同一菌种菌落数超过10万/毫升可明确病原体。肾功能检查早期可能正常，随着病情进展可出现血肌酐升高、肾小球滤过率下降。肾脏超声可观察肾脏形态，慢性肾盂肾炎患者可能出现肾脏体积缩小、皮质变薄或瘢痕形成。静脉肾盂造影能更直观显示肾盂肾盏变形、扩张或狭窄等结构异常，但肾功能严重受损者需慎用。
确诊慢性肾盂肾炎后需注意避免高盐高脂饮食，限制蛋白质摄入量但保证优质蛋白比例，每日饮水量保持在2000毫升以上以促进排尿冲刷尿路。避免憋尿和会阴部清洁不当，适度运动增强免疫力，冬季注意腰部保暖。定期复查尿常规、尿培养及肾功能，若出现发热、腰痛加重或尿频尿急等症状需及时就医。合并高血压或水肿者需严格监测血压，遵医嘱调整降压药物。