婴儿肝炎综合征通常可以治好，多数患儿经过规范治疗后可痊愈。该病主要由病毒感染、胆道闭锁、遗传代谢异常等因素引起，需根据病因采取抗病毒、手术或营养支持等治疗。
病毒感染引起的婴儿肝炎综合征以巨细胞病毒、风疹病毒等感染多见，患儿可能出现黄疸、肝脾肿大等症状。医生可能使用更昔洛韦注射液、干扰素α2b注射液等抗病毒药物，配合护肝治疗。胆道闭锁患儿需在出生后60天内接受葛西手术或肝移植，术后需长期使用熊去氧胆酸胶囊等利胆药物。遗传代谢异常如酪氨酸血症需限制蛋白质摄入，使用尼替西农胶囊等特殊药物治疗。部分胆汁淤积型患儿对苯巴比妥片联合维生素K1注射液治疗反应良好。早产儿或低体重儿可能需静脉营养支持，逐步过渡到特殊配方奶粉喂养。
极少数合并严重肝纤维化或肝硬化患儿预后较差，需评估肝移植指征。某些遗传代谢病如糖原累积症可能需终身治疗。若合并多器官功能衰竭或严重感染，可能影响治疗效果。染色体异常相关综合征患儿可能伴随其他系统畸形，需多学科协作管理。未及时干预的胆道闭锁患儿在3个月后手术成功率显著下降。
家长应定期监测患儿黄疸消退情况，记录大小便颜色变化。母乳喂养母亲需避免高脂饮食，人工喂养可选择含中链甘油三酯的配方奶粉。保持皮肤清洁防止胆汁酸沉积引起瘙痒，接触患儿前后严格洗手预防交叉感染。康复期每3个月复查肝功能，按计划接种疫苗。避免使用对肝脏有损伤的药物，居住环境保持通风减少呼吸道感染风险。发现患儿嗜睡、拒奶或抽搐等异常表现时需立即就医。